惠州一战，邓铿声名鹊起。广东全省光复后，升任广东陆军第一混成协协统，广东都督府陆军司长兼稽查局长，后改任都🃘😆督府参谋长。
一九一三年邓铿任琼崖镇守使。二🕲次革命时起兵反袁，与龙济光激战于三水，失败后逃♐🙿亡日本。
在日本，他追随孙中山在日本加入中华🆢👋革命党，任军务🟙部副部长。从此之后，邓铿一直是孙中山的得力助手。
在讨袁（世凯）驱龙（🛃🙭济光）、护法援闽等战事中打了无数硬仗。在当时，邓铿与朱执信、廖仲恺被同视为孙中山的股肱心膂。朱、廖二人是政治活动家，邓铿则是掌握军权的重量级人🛱物，孙中山在军事上很多时候要依💫🔳赖邓铿。
邓铿待人仁厚，律己廉洁，治家节俭，常常以⚕减衣缩食来勉励家人。在福建征战期间，他对自己的要求尤为严格，“月受俸仅百二十金，即平日轻慢公者，亦为赞叹而敬服”。
他经常对下属和朋友说“近来人心常以做官为黩货途径，及其已🄹🂡得，则消耗与嗜。即稍稍储积，其🝟🌝⛫结果不🖬🕰🍐过增加自身罪恶，而陷后人于有恃无恐，不克振拔之地而已。”
闻🌂者皆服为名论。难怪胡汉🜹民称邓仲元为“武人之中，高节远瞩，惟公为能”。
邓铿治军严谨，廉政不阿，嫉恶如仇。他对⚐🐟军中不肖分子包🏿庇烟赌的行径，毫不徇情，并多次派出宪兵，专门缉拿偷运烟土☑⚘👬的官兵。
有一次，他在广州晏公街缉获烟土两百多担，查明是陈炯明的部署洪兆麟、陈炯光、陈觉民等人伙同所为。虽与陈炯明是生死患难之交，但并没有睁一只眼闭一只眼，召☐集⚝💗广州各界代表和各国驻广州领事，共同监督将烟土焚于东郊。
此举被当时的人们赞颂为林则徐之后的第二次大规模焚毁鸦片。有人劝他做事要少与自己树敌，以免给自己带来杀身之祸。邓铿则说“怕死则不必作革命事业，丈夫宁玉碎耳🍠，何虑？”
但是，此时的邓铿还没有想到，他的这一系列廉政不阿🟙，嫉恶如仇之举，已经为他日后遇刺埋🜱🅽下了祸根。
陈炯明的亲信有犯法的🛃🙭，常受邓铿🕲的呵斥，陈的左右对邓铿积怨甚深。认为邓铿是🞥🖑👶粤军中的孙中山亲信，视如眼中之钉。
孙中山出师时，邓铿特拨自辖的一团🝪🍼为孙的警卫团，以邓的副官长陈可钰统率，用以保护孙的安全。北伐军军饷，就是邓铿一力筹措的。
三月中旬，孙中山的代表伍朝枢和段祺瑞的密使周善培从北方到了香港，邓铿和总统府♐🙿秘书长谢持由🐌⚀广州专程赴香港迎接。这次行踪除了粤军总司令部重要人物知道外，并无外人知悉。邓启程时，陈炯明曾亲自送到楼梯。
一九二二年三月二十一日傍晚七时，邓铿从香港返回广州，在广九车站下车。即将登上汽车前，忽然人群中响起了枪声。邓仲元身中两弹，一弹掠过腹部，微伤，另一颗子⚝💗弹则贯胃部而出，重伤。
邓铿中枪负伤🍍后第一时间仍想奋力🕲抓住凶手，但🂴📄是伤重不支，只好马上命令司机赶回省署。