石亨本来因为违犯了军法被削职，是于谦请求明代宗宽恕了他，让他总理十营兵，但因为害怕于谦不敢放肆，也不喜欢于谦。
德胜门一仗的胜利，石亨的功劳并不比于谦大，而得到世袭侯爵，内心有愧，于是上书推荐于谦的儿子于冕。
明代宗下诏让他到京师，于谦推辞，明代宗不准，于谦说：
“国家多事的时候，臣子在道义上不应该顾及个人的恩德，而且石亨身为大将，没有听说他举荐一位隐士，提拔一个兵卒，以补益军队国家。
而只是推荐了我的儿子，这能得到公众的认可吗？我对于军功，极力杜绝侥幸，绝对不敢用儿子来滥领功劳。”
石亨更是又愧又恨，都督张辄因为征苗时不守律令，被于谦弹劾，和内侍曹吉祥等都一向恨于谦。
公元1457年，明代宗朱祁钰病重，正月壬午，石亨和曹吉祥、徐有贞迎接英宗恢复了帝位，宣谕朝臣以后，立即把于谦和大学士王文逮捕入狱。
诬陷于谦等和黄囗制造不轨言论，又和太监王诚、舒良、张永、王勤等策划迎接册立襄王，石亨等拿定这个说法，唆使科道官上奏。
都御史萧维祯审判定罪，坐以谋反，判处死刑，王文忍受不了这种诬陷，急于争辩，于谦笑着说：
“这是石亨他们的意思罢了，分辩有什么用处？”
奏疏上呈后，英宗还有些犹豫，说：
“于谦是有功劳的。”
徐有贞进言说：
“不杀于谦，复辟这件事就成了出师无名。”
明英宗的主意便拿定了，正月二十三日，于谦被押往崇文门外，就在这座他曾拼死保卫的城池前，得到了他最后的结局——斩决。